Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlr5Q9JLF7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tlr5Q9JLF7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tlr5Q9JLF7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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