Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsmQ9JL96 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtsmQ9JL96 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtsmQ9JL96 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtsmQ9JL96 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CtsmQ9JL96 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsmQ9JL96 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms