Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmx1aQ9JKU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms