Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Irx5Q9JKQ4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx5Q9JKQ4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms