Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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