Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rcl1Q9JJT0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rcl1Q9JJT0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms