Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc86Q9JJ89 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ccdc86Q9JJ89 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc86Q9JJ89 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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