Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad9Q9JIW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms