Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms