Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LratQ9JI60 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LratQ9JI60 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms