Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ropn1Q9ESG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms