Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3bQ9ES34 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms