Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snap29Q9ERB0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snap29Q9ERB0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms