Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tfip11Q9ERA6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfip11Q9ERA6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfip11Q9ERA6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tfip11Q9ERA6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tfip11Q9ERA6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tfip11Q9ERA6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms