Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clstn2Q9ER65 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clstn2Q9ER65 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clstn2Q9ER65 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms