Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ndst3Q9EQH7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndst3Q9EQH7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ndst3Q9EQH7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Ndst3Q9EQH7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Ndst3Q9EQH7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Ndst3Q9EQH7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ndst3Q9EQH7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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