Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SgshQ9EQ08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms