Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rp2Q9EPK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp2Q9EPK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp2Q9EPK2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp2Q9EPK2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp2Q9EPK2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp2Q9EPK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rp2Q9EPK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms