Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgap1Q9EPJ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms