Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r50Q9EP51 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r50Q9EP51 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms