Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde1Q9DBZ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syde1Q9DBZ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms