Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syvn1Q9DBY1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syvn1Q9DBY1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms