Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf6Q9DBU5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf6Q9DBU5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf6Q9DBU5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf6Q9DBU5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf6Q9DBU5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf6Q9DBU5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf6Q9DBU5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms