Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf1Q9DBU0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms