Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fundc1Q9DB70 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fundc1Q9DB70 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms