Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erv3Q9DAX3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erv3Q9DAX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms