Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700016D06RikQ9DAA5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700016D06RikQ9DAA5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms