Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc89Q9DA73 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms