Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y8

Ssmem1, RIKEN cDNA 1700025E21, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssmem1Q9D9Y8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssmem1Q9D9Y8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ssmem1Q9D9Y8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ssmem1Q9D9Y8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssmem1Q9D9Y8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssmem1Q9D9Y8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ssmem1Q9D9Y8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssmem1Q9D9Y8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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