Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdzd9Q9D9M4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms