Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l1Q9D9H3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms