Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldnd2Q9D9H2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms