Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TcimQ9D915 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms