Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms