Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rexo2Q9D8S4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms