Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp4bQ9D8B3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4bQ9D8B3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms