Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnajc4Q9D844 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc4Q9D844 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms