Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms