Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms