Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2310002L09RikQ9D7L5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms