Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Capns2Q9D7J7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Capns2Q9D7J7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms