Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Srp19Q9D7A6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Srp19Q9D7A6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Srp19Q9D7A6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp19Q9D7A6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Srp19Q9D7A6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Srp19Q9D7A6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Srp19Q9D7A6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Srp19Q9D7A6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Srp19Q9D7A6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srp19Q9D7A6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Srp19Q9D7A6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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