Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms