Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc94Q9D6J3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms