Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rab11fip1Q9D620 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11fip1Q9D620 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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