Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PudpQ9D5U5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms