Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fam227bQ9D518 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fam227bQ9D518 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms