Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms