Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clvs1Q9D4C9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clvs1Q9D4C9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms