Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp2bpQ9D4C6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp2bpQ9D4C6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms